Aide à la démarche de médecine fondée sur les preuves

Clinithèque est issue d'un projet de thèse visant à proposer une encyclopédie de séméiologie en ligne, s'inscrivant dans une démarche de médecine fondée sur les preuves. En ce sens, il est donc important d'appuyer chaque information, qu'elle soit de description séméiologique ou de valeur diagnostique, de sources scientifiques fiables et relues par les pairs.

Il convient de citer les études en fournissant les liens permettant de les consulter, notamment sur les moteurs de recherche comme PubMed.

Méthodologie
Durant l'élaboration initiale de Clinithèque, un protocole de recherche d'articles d'intérêt et de traitement des informations a été mis au point. En voici les principales étapes.

Étape 1 : Élaboration d'une liste d'entités pathologiques
Les référentiels universitaires admis durant les études médicales de la faculté de Lille ont été relus, et les entités pathologiques (par exemple : lésions méniscales, tendinopathies de la coiffe des rotateurs) en ont été extraites pour dresser une liste.

Étape 2 : Recherche sur PubMed
Une entité pathologique est sélectionnée et la recherche bibliographique peut commencer, en cherchant les articles sur PubMed.

Dans le cas de l'appareil locomoteur, afin d'être au plus large, le premier mot clé choisi est celui de la structure anatomique concernée. Par exemple, pour chercher les articles parlant des lésions méniscales, le mot clé "meniscus" a été utilisé.

Un deuxième mot clé, ou plutôt un ensemble de mots clés permettant de cibler l'examen clinique, est utilisé : "clinical examination" OR "clinical evaluation" OR "physical examination" OR "physical evaluation".

Enfin, afin d'obtenir des articles citant les valeurs diagnostiques obligatoires, deux derniers mots clés sont requis : "sensitivity" AND "specificity".

On obtient la formule suivante : ((meniscus) AND ("clinical examination" OR "clinical evaluation" OR "physical examination" OR "physical evaluation")) AND ("sensitivity" AND "specificity") PubMed nous renvoie une longue liste d'études portant sur le sujet. Dans le cadre de la thèse initiale, seuls les articles publiés jusqu'en 2020 ont été intégrés. Bien sûr, tous ne sont pas forcément d'intérêt pour notre travail.

Étape 3 : Présélection des études
Tous les abstracts des articles obtenus sont lus afin de permettre une première réduction des articles qui seront effectivement lus dans leur intégralité.

Les critères d'exclusions de cette première sélection sont les suivants :


 * Articles évaluant l'examen clinique de façon globale, sans détailler les valeurs diagnostiques liées à chaque signe ou manœuvre individuellement.
 * Articles utilisant des seuils ou des interprétations non binaires de la positivité d'un signe ou d'une manœuvre clinique (par exemple : sensibilité et spécificité pour une douleur légère, douleur intermédiaire, douleur forte etc).
 * Articles évaluant l'examen clinique en post-traitement (par exemple pour évaluer la récupération après chirurgie réparatrice).
 * Articles dont les signes cliniques ne sont pas toujours réalisables au cabinet médical (par exemple : nécessité d'anesthésie loco régionale).
 * Articles non disponibles en français ou en anglais.
 * Articles dont le corpus est indisponible.

Tout article ne correspondant pas à la pathologie ou zone anatomique concernée dans la recherche, mais correspondant à une autre entité (par exemple un article portant sur les ligaments croisés alors que l'on cherchait des études sur les ménisques) n'est pas exclu mais mis de côté pour être intégré dans la section correspondante.

Étape 4 : Lecture et analyse des études présélectionnées
Les études retenues par cette première sélection sont donc lues afin de voir si elles correspondent effectivement à notre problématique.

Les critères d'exclusion de cette seconde sélection soit identiques aux précédents, avec en plus :


 * Articles n'étant que de simples revues de littérature ne proposant pas de nouvelle donnée, notamment pas de valeur diagnostique regroupée.
 * Articles ne portant pas sur un échantillon de population.
 * Article ne citant pas de gold standard.
 * Articles ne citant pas au moins la sensibilité et la spécificité des signes étudiés.
 * Article non daté.

Si un article étudie un signe clinique dans un contexte particulier (par exemple : étude réalisée en ambulatoire, lésion méniscale recherchée dans le cadre d'une lésion ligamentaire déjà diagnostiquée), ce contexte doit être précisé quand les valeurs diagnostiques sont citées sur Clinithèque.

Étape 5 : Extraction des données d'intérêt
Pour toutes les études ne rencontrant aucun critère d'exclusion, toutes ces données sont extraites :


 * Niveau de preuve de l'étude selon le NHMRC 2009 (disponibles à la page 34 des recommandations HAS ci-contre).
 * Type d'étude (Méta-analyse, cohortes prospectives, études prospectives de niveau III, études rétrospectives).
 * Année de parution de l'article.
 * Description des signes cliniques (si disponible).
 * Circonstances cliniques et données d'interrogatoire associées (si disponibles).
 * Gold Standard utilisé.
 * Valeurs diagnostiques : au moins la sensibilité et la spécificité, mais la valeur prédictive positive et la valeur prédictive négative sont également retenues si elles sont disponibles.

Étape 6 : Mise en page sur Clinithèque
Une fois toutes ces données en main, il ne reste plus qu'à les présenter au propre sur Clinithèque selon les modèles proposés en accueil. Pour plus d'information, veuillez consulter les pages Règles d'édition, Créer ou éditer une page ou encore Modèle de nouvelle page.

Étape 7 : Réalisation des schémas
Ces schémas sont réalisés par le créateur de Clinithèque et ajoutés aux pages a posteriori. Ils sont dessinés d'après les descriptions extraites des articles d'intérêt.